Такое поведение нормально для недавно приобретенной свинки, иногда на привыкание к новой обстановке и целый месяц уходит.
Что касается болячек, обрабатывайте их хлоргексидином. Это могут быть покусы сородичей, если они содержались в тесной клетке по несколько свинок. Осмотрите шерсть и кожу на предмет паразитов. Если будут появляться новые ранки, или зуд усилится, обратитесь в клинику, может быть и подкожный клещ.